Получение субсидии после приобретения оборудования само по себе не означает автоматическое восстановление НДС. Прежде всего необходимо определить, на какие именно расходы были выделены бюджетные средства и какие условия содержатся в соглашении о предоставлении субсидии.
Если организация уже заявила входной НДС к вычету, а затем получила компенсацию понесенных расходов из бюджета, следует проанализировать, предусмотрено ли в документах финансирование затрат без учета НДС. При отсутствии такого условия налоговые органы, как правило, рассматривают субсидию как источник возмещения расходов вместе с суммой налога.
В такой ситуации ранее заявленный вычет необходимо скорректировать. Если субсидия покрыла стоимость приобретения полностью, восстановлению подлежит вся сумма НДС. Если бюджетное финансирование компенсировало лишь часть расходов, налог восстанавливается пропорционально размеру полученной субсидии.
Особенно часто такая ситуация возникает, когда компания:
- приобрела оборудование;
- приняла входной НДС к вычету;
- получила субсидию на компенсацию части затрат, а в соглашении о субсидии нет прямой формулировки, что финансирование предоставлено без учета НДС.
В такой ситуации безопасный вариант - восстановить НДС в той части, которая приходится на расходы, возмещенные за счет субсидии.